Baleen berbaroa es un thriller histórico situado en un pueblo de la costa vasca, Mundatxa durante el siglo XVI. Una ballena es avistada por varios marinos del pueblo, que inmediatamente se disponen a darle caza. Durante la caza de la ballena, se despiertan viejas rivalidades y rencillas entre los participantes, siendo estas desavenencias la antesala de la muerte del pescador local Ezkerti que aparece muerto en circunstancias un tanto extrañas que llevan al jóven Sebastián a indagar entre los miembros de la Cofradía de pescadores de Mundatxa. Sebastián recibe el consejo del armador Agirre, encerrado en un mensaje críptico : Lo que está bajo tierra, ¡es semilla o cadáver?. Pronto descubrirá Sebastián nuevos sucesos, hasta que decide enrolarse en la Armada que se dispone a partir para la Jornada de Inglaterra.